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原代细胞培养
16S/ITS分型

时间:2019-01-15 浏览:536次

16S /ITS菌种鉴定

通过DNA 测序对微生物进行物种鉴定(菌种鉴定)是比传统生化鉴定更先进的鉴定方法。DNA 测序不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。比传统生化鉴定更加快速,准确。麟美生物提供的微生物物种鉴定服务包括细菌16s rDNA鉴定和真菌26s rDNA鉴定、真菌ITS和真菌18s 鉴定。

提供样品

基因组DNA:浓度≥ 10 ng/μl,总体积≥ 20 μl,革兰氏阳性细菌由于细胞壁较厚,最好提供基因组DNA;

带有单菌落的平板或斜面:应长有至少分离三次以上的单菌落。

交付报告

PCR 产物照片;

菌种鉴定NCBI 参考结果;

测序彩色波形图;

测序方向图;

序列碱基图。


16S DNA测序技术服务

技术原理

16S rDNA为编码原核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列,具有10个保守区和9个高变区,其中保守区在细菌间差异不大,高变区具有属或种的特异性,随亲缘关系不同而存在差异。16S rDNA扩增子测序,通常是选择1-2个高变区,利用保守区设计通用引物进行PCR扩增,再对高变区进行测序分析和菌种鉴定。16S rDNA扩增子测序技术是研究环境样品中微生物群落结构组成、挖掘样品之间差异的重要手段。


16S rDNA结构示意图


16S rDNA常用引物



实验路线


为提高数据的利用效率,扩增子通常进行混样建库,为此需要在上下游引物的5’端加6-8个碱基的barcode序列,用于区分不同的样品;PCR产物检测合格后,等质量混合到一起,构建PCR-free文库并上机测序。


技术路线




样本要求




注:扩增子测序结果的准确性受DNA质量影响较大,所以前期样本采集的过程一定要保证快速和低温环境,提取过程也要确保DNA的完整性和提取量。


实验周期 

样本质检合格后,22个工作日。


一站式整体科研服务,成就更高水平的科研成果

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麟美生物主营业务包括实验动物模型建立、分子生物学、载体构建、细胞转染、基因治疗实验、细胞功能验证、基因敲出/入、原代培养、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立等多项科研技术服务,并建立了涵盖实验设计、项目实施、结果整理、数据分析及策略咨询等一站式的科研服务体系并提供全方位科研方案。


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