建立病毒检测的新技术基本上应从3个方面考虑,即对病毒抗原的检测、对病毒产生抗体的检测和对病毒基因的检测。除亚病毒外,病毒体主要由核酸和蛋白质组成,核心为核酸,为病毒增殖、遗传与变异等功能提供信息,是病毒存在所必需的。于待检者体内检测到病毒核酸的存在,是证明病毒感染的直接指标。病毒核酸由DNA和RNA组成,两者不共存于同一病毒颗粒内。病毒DNA和RNA还有双链与单链、正链与负链、双线状与线状以及分节段与不分节段之分。随着分子生物学技术的发展,很多病毒的核酸序列已被弄清楚[4],20世纪80年代初期,建立了核酸分子杂交法。例如,利用非放射性探针建立的检测HCVRNA的方法。同时利用探针结合原位杂交(Situhybridization)检测组织或细胞内的病毒RNA对病理诊断及治疗均有很大帮助。

病毒基因检测系统，以聚合酶链式反应（简称PCR）技术为核心，通过体外快速扩增DNA的方法，用于放大特定的DNA片段，数小时内可使目的基因片段扩增到数百万个拷贝。这样就能准确的检测病毒的基因数，以此换算病毒量。

目前多应用于乙肝病毒量的检测以及HIV病毒基因（即HIV核酸检测）检测之中。
HIV核酸检测是利用分子生物学的理论和技术，通过直接探查病毒核酸的存在与否，从病毒的核酸结构来分析核酸的功能，从而对人体状态与疾病做出诊断的方法。它的目标分子是DNA或RNA，反映核酸的结构和功能，用于诊断有无病原体感染，是目前世界上最先进、最精确的疾病检测手段。