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原代细胞培养
全基因组测序

时间:2021-03-04 浏览:547次


全基因组测序

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是最早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基因组计划。除了美国之外,日本在1981年就已经开始研究相关问题,但是并没有美国那样积极。到了1988年,詹姆士·华生(DNA双螺旋结构发现者之一)成为NIH的基因组部门主管。1990年开始国际合作。1996年,多个国家召开百慕达会议,以2005年完成测序为目标,分配了各国负责的工作,并且宣布研究结果将会及时公布,并完全免费。

应用领域

(1) 全基因组范围内多性状的定位;

(2) 目标性状的生物学基础研究。

产品优势

(1) 高通量检测全基因组SNP并进行关联分析,扫除定位盲点;

(2) 重重筛选SNP,多重检验显着性,保证结果准确性;

(3) 同时对多种性状进行定位;

(4) 定位精度最多可达单基因水平。

标准信息分析

(1) 已有参考基因组序列的动植物自然群体;

(2) 样本间无明显的亚群分化(如生殖隔离等);

(3) 所研究表型性状遗传力较强。

(4) ≥200个样本;

(5) 基于SNP≥5 X/个体;

(6) 基于CNV≥30X/个体 10~20W Tags

(7) 平均8 X/Tag

(8) 测序数据质量评估;

(9) 与参考基因组比对;

(10) SNPCNV检测及注释 SNP检测及注释;

高级信息分析

(1) 构建系统进化树;

(2) 群体主成分分析;

(3) 连锁不平衡分析;

(4) 性状关联分析;

(5) 目标性状相关区域基因功能注释;

(6) 构建单体型图谱。

样品要求

(1) 样品类型:基因组DNA

(2) 样品需求量:单次2 ug

(3) 样品浓度:文库≥30 ng/μl

(4) 样品纯度:OD260/2801.8-2.0

(5) 电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解。(距送样日最近的电泳结果)







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