
时间:2021-03-04 浏览:1430次
全基因组DNA甲基化测序
全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。
基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。精准获得全基因组甲基化的C位点,是甲基化测序的金标准;全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。具有“高效、精准、超值”的优势,已广泛应用于人和动植物研究。
WGBS |
分析内容 |
解决问题 |
标准分析 |
测序数据质量评估 |
过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
与参考基因组比对 |
比对率和覆盖度分析 |
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甲基化位点calling |
分析甲基化位点 |
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甲基化分布 |
甲基化在基因组,染色体,功能元件上的分布 |
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差异甲基化分析 |
寻找DMR |
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相关基因分析 |
相关基因GO,KEGG富集分析 |
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多样本分析 |
PCA分析多样本甲基化变化规律 |
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