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原代细胞培养
全基因组甲基因测序

时间:2021-03-04 浏览:333次

全基因组DNA甲基化测序

全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite SequencingWGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种在全基因组水平进行高精准甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。

基于全基因组重亚硫酸盐转化的WGBS法,实现单碱基分辨率的甲基化位点精准、高效定位。精准获得全基因组甲基化的C位点,是甲基化测序的金标准;全面分析不同处理对全基因组甲基化水平的影响,快速准确地找到差异甲基化区域。具有高效、精准、超值的优势,已广泛应用于人和动植物研究。

 

WGBS

分析内容

解决问题

标准分析

测序数据质量评估

过滤掉低质量数据,保证数据质量

与参考基因组比对

比对率和覆盖度分析

甲基化位点calling

分析甲基化位点

甲基化分布

甲基化在基因组,染色体,功能元件上的分布

差异甲基化分析

寻找DMR

相关基因分析

相关基因GOKEGG富集分析

多样本分析

PCA分析多样本甲基化变化规律

 


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