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原代细胞培养
BSP甲基化测序

时间:2021-03-05 浏览:346次

BSP甲基化测序

亚硫酸氢盐处理后测序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是检测基因甲基化的经典方法,其原理为:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。

基因组DNA经亚硫酸盐处理后,设计BSP引物扩增目的片段,此时尿嘧啶(U)全部转化为胸腺嘧啶(T),最后对PCR产物进行测序就可以判断CpG位点是否发生甲基化。

 

技术优势

(1) 检测序列长,可长达200-400bp

(2) 分辨率高,可检测到每一个碱基的甲基化状况

(3) 对于样品要求低,适用于新鲜、冷冻和FFPE样本

 

服务内容

1. 基因组DNABisulfite转化;

2. BSPBisulfite Sequencing PCR)法,包括引物设计与合成,TA克隆测序及数据分析。

 

样品要求

(1) 若提供基因组DNA,需≥2μg

(2) 若提供的材料为新鲜组织、血液、细胞等生物材料,请提供足够提取2μg以上基因DNA的材料量

(3) 基于所选择的DNA甲基化检测方法,请提供相应的引物或引物序列

 

BSP服务完成时提供

(1) Bisulfite处理的基因组DNA

(2) 实验报告(包括BSP产物的直接测序报告)

(3) 5个有效的阳性克隆

(4) 空点图

 

结果展示

BSP测序图

 

BSP点状图和BSP序列比对

 

BSP柱状图